Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FmodP50608 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FmodP50608 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FmodP50608 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FmodP50608 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FmodP50608 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FmodP50608 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FmodP50608 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FmodP50608 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FmodP50608 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FmodP50608 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FmodP50608 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FmodP50608 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FmodP50608 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FmodP50608 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FmodP50608 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FmodP50608 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FmodP50608 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FmodP50608 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FmodP50608 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FmodP50608 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FmodP50608 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FmodP50608 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FmodP50608 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FmodP50608 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FmodP50608 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FmodP50608 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FmodP50608 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FmodP50608 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FmodP50608 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FmodP50608 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FmodP50608 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FmodP50608 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FmodP50608 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FmodP50608 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FmodP50608 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FmodP50608 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FmodP50608 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FmodP50608 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FmodP50608 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FmodP50608 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FmodP50608 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FmodP50608 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FmodP50608 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FmodP50608 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FmodP50608 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FmodP50608 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FmodP50608 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FmodP50608 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FmodP50608 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FmodP50608 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FmodP50608 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FmodP50608 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FmodP50608 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FmodP50608 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FmodP50608 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FmodP50608 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FmodP50608 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FmodP50608 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FmodP50608 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FmodP50608 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms