Protein–RNA interactions for Protein: P48318

Gad1, Glutamate decarboxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gad1P48318 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gad1P48318 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gad1P48318 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gad1P48318 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gad1P48318 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gad1P48318 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gad1P48318 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gad1P48318 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gad1P48318 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gad1P48318 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Gad1P48318 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gad1P48318 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gad1P48318 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gad1P48318 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gad1P48318 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gad1P48318 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gad1P48318 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gad1P48318 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gad1P48318 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gad1P48318 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gad1P48318 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gad1P48318 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gad1P48318 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gad1P48318 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gad1P48318 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gad1P48318 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gad1P48318 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gad1P48318 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gad1P48318 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gad1P48318 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gad1P48318 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms