Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr3P43300 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Egr3P43300 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Egr3P43300 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms