Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chd1P40201 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chd1P40201 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Chd1P40201 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chd1P40201 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd1P40201 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd1P40201 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Chd1P40201 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chd1P40201 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chd1P40201 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chd1P40201 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Chd1P40201 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chd1P40201 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms