Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprkP35822 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprkP35822 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprkP35822 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprkP35822 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprkP35822 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprkP35822 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtprkP35822 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprkP35822 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprkP35822 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprkP35822 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtprkP35822 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtprkP35822 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprkP35822 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
PtprkP35822 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms