Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd1P33215 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nedd1P33215 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nedd1P33215 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms