Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc11P31313 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc11P31313 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms