Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
Hoxa11P31311 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms