Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdk4P30285 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms