Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgfb2P27090 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms