Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aldh1a1P24549 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh1a1P24549 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms