Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf239P24399 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Znf239P24399 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Znf239P24399 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Znf239P24399 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Znf239P24399 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Znf239P24399 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Znf239P24399 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf239P24399 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf239P24399 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf239P24399 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf239P24399 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf239P24399 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf239P24399 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf239P24399 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf239P24399 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf239P24399 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf239P24399 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf239P24399 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf239P24399 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Znf239P24399 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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