Protein–RNA interactions for Protein: P23804

Mdm2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm2P23804 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mdm2P23804 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mdm2P23804 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mdm2P23804 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mdm2P23804 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mdm2P23804 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdm2P23804 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdm2P23804 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdm2P23804 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdm2P23804 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdm2P23804 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdm2P23804 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdm2P23804 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdm2P23804 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdm2P23804 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdm2P23804 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mdm2P23804 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms