Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ms4a2P20490 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ms4a2P20490 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms