Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P20040 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P20040 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P20040 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P20040 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P20040 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P20040 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P20040 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P20040 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P20040 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P20040 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P20040 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P20040 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P20040 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P20040 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P20040 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P20040 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P20040 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P20040 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P20040 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P20040 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P20040 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P20040 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P20040 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P20040 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P20040 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P20040 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P20040 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P20040 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P20040 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P20040 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P20040 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P20040 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P20040 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P20040 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P20040 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P20040 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P20040 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P20040 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P20040 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P20040 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P20040 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
P20040 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P20040 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P20040 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P20040 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P20040 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P20040 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P20040 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P20040 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P20040 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P20040 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P20040 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms