Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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PdgfaP20033 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PdgfaP20033 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PdgfaP20033 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PdgfaP20033 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfaP20033 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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