Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cxcl9P18340 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl9P18340 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms