Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dnmt1P13864 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Dnmt1P13864 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms