Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd1P13516 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd1P13516 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd1P13516 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd1P13516 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd1P13516 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd1P13516 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scd1P13516 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd1P13516 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd1P13516 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd1P13516 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd1P13516 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd1P13516 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd1P13516 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd1P13516 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms