Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd8bP10300 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms