Protein–RNA interactions for Protein: P02831

Hoxa3, Homeobox protein Hox-A3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa3P02831 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa3P02831 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms