Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01790 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01790 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01790 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01790 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01790 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01790 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01790 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01790 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01790 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01790 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01790 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01790 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01790 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01790 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01790 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01790 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01790 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01790 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01790 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01790 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01790 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01790 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01790 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01790 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01790 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01790 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01790 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01790 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01790 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01790 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01790 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01790 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01790 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01790 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01790 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
P01790 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01790 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01790 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01790 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01790 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01790 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01790 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01790 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01790 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01790 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01790 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01790 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01790 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01790 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01790 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01790 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01790 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01790 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01790 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01790 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01790 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01790 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01790 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01790 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01790 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01790 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01790 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01790 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01790 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01790 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01790 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01790 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01790 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01790 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01790 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01790 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01790 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01790 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01790 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01790 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01790 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01790 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01790 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01790 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01790 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01790 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01790 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01790 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01790 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01790 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01790 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01790 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01790 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01790 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01790 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01790 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01790 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01790 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01790 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01790 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01790 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01790 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01790 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01790 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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