Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01740 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
P01740 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01740 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01740 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01740 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01740 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01740 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01740 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01740 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01740 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01740 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01740 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01740 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01740 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01740 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01740 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01740 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01740 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01740 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01740 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01740 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01740 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01740 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01740 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01740 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01740 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01740 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01740 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01740 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01740 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01740 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01740 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01740 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P01740 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01740 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01740 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P01740 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01740 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01740 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01740 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01740 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01740 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01740 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01740 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01740 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01740 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01740 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01740 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01740 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01740 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01740 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01740 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01740 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01740 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01740 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01740 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01740 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01740 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01740 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01740 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01740 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01740 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01740 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01740 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01740 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01740 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01740 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01740 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01740 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01740 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01740 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01740 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01740 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01740 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01740 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01740 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01740 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01740 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01740 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01740 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01740 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01740 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01740 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01740 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01740 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01740 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01740 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01740 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01740 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01740 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01740 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01740 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01740 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01740 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01740 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01740 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01740 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01740 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01740 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms