Protein–RNA interactions for Protein: P01663

Ig kappa chain V-III region PC 4050, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01663 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01663 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01663 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01663 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01663 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01663 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01663 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01663 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01663 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01663 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
P01663 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01663 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01663 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01663 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01663 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01663 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01663 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01663 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01663 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01663 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01663 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01663 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01663 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01663 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01663 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01663 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01663 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01663 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01663 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01663 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01663 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01663 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01663 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01663 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01663 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01663 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01663 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01663 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01663 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01663 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01663 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01663 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01663 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01663 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01663 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01663 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01663 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01663 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01663 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01663 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01663 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01663 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01663 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01663 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01663 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01663 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01663 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01663 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01663 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01663 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01663 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01663 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01663 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01663 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01663 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01663 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01663 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01663 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01663 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01663 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01663 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01663 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01663 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01663 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01663 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01663 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01663 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01663 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01663 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01663 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01663 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01663 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01663 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01663 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01663 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01663 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01663 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01663 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01663 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01663 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01663 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01663 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01663 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01663 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01663 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01663 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01663 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01663 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01663 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01663 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms