Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01659 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01659 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01659 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01659 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01659 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01659 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01659 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01659 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01659 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01659 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01659 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01659 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01659 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01659 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01659 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01659 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01659 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01659 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01659 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01659 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01659 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01659 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01659 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01659 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01659 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01659 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01659 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01659 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01659 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01659 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01659 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01659 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01659 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01659 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01659 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01659 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01659 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01659 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01659 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01659 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01659 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01659 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01659 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01659 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01659 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01659 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01659 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01659 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01659 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01659 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01659 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01659 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01659 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01659 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01659 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms