Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CpdO89001 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CpdO89001 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CpdO89001 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CpdO89001 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CpdO89001 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CpdO89001 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CpdO89001 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CpdO89001 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CpdO89001 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CpdO89001 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CpdO89001 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CpdO89001 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CpdO89001 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CpdO89001 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CpdO89001 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CpdO89001 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CpdO89001 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CpdO89001 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CpdO89001 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CpdO89001 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CpdO89001 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CpdO89001 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CpdO89001 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CpdO89001 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CpdO89001 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CpdO89001 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CpdO89001 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CpdO89001 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CpdO89001 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CpdO89001 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CpdO89001 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CpdO89001 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CpdO89001 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CpdO89001 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CpdO89001 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CpdO89001 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CpdO89001 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CpdO89001 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CpdO89001 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CpdO89001 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CpdO89001 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CpdO89001 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CpdO89001 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CpdO89001 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CpdO89001 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CpdO89001 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CpdO89001 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CpdO89001 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CpdO89001 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CpdO89001 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CpdO89001 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CpdO89001 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CpdO89001 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CpdO89001 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CpdO89001 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CpdO89001 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CpdO89001 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CpdO89001 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CpdO89001 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CpdO89001 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CpdO89001 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CpdO89001 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CpdO89001 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CpdO89001 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CpdO89001 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CpdO89001 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CpdO89001 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CpdO89001 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CpdO89001 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CpdO89001 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CpdO89001 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CpdO89001 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CpdO89001 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CpdO89001 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CpdO89001 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CpdO89001 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CpdO89001 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CpdO89001 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CpdO89001 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CpdO89001 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CpdO89001 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CpdO89001 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CpdO89001 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CpdO89001 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CpdO89001 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CpdO89001 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CpdO89001 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CpdO89001 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CpdO89001 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CpdO89001 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CpdO89001 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CpdO89001 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CpdO89001 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CpdO89001 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CpdO89001 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CpdO89001 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CpdO89001 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CpdO89001 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CpdO89001 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms