Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops3O88543 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops3O88543 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops3O88543 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops3O88543 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cops3O88543 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cops3O88543 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cops3O88543 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms