Protein–RNA interactions for Protein: O70300

Pspn, Persephin, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PspnO70300 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PspnO70300 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PspnO70300 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PspnO70300 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PspnO70300 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PspnO70300 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PspnO70300 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PspnO70300 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PspnO70300 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PspnO70300 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PspnO70300 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PspnO70300 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PspnO70300 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PspnO70300 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PspnO70300 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PspnO70300 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PspnO70300 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PspnO70300 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PspnO70300 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PspnO70300 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PspnO70300 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PspnO70300 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PspnO70300 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PspnO70300 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PspnO70300 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PspnO70300 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PspnO70300 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PspnO70300 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PspnO70300 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PspnO70300 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PspnO70300 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PspnO70300 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PspnO70300 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PspnO70300 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PspnO70300 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PspnO70300 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PspnO70300 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PspnO70300 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PspnO70300 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PspnO70300 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PspnO70300 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PspnO70300 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PspnO70300 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PspnO70300 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PspnO70300 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PspnO70300 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PspnO70300 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PspnO70300 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PspnO70300 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PspnO70300 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PspnO70300 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PspnO70300 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PspnO70300 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PspnO70300 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PspnO70300 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PspnO70300 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PspnO70300 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PspnO70300 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PspnO70300 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PspnO70300 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PspnO70300 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PspnO70300 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PspnO70300 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PspnO70300 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PspnO70300 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PspnO70300 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PspnO70300 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PspnO70300 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PspnO70300 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PspnO70300 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PspnO70300 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PspnO70300 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PspnO70300 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PspnO70300 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PspnO70300 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PspnO70300 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PspnO70300 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PspnO70300 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PspnO70300 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PspnO70300 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PspnO70300 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PspnO70300 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PspnO70300 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PspnO70300 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PspnO70300 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PspnO70300 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PspnO70300 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PspnO70300 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PspnO70300 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PspnO70300 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PspnO70300 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PspnO70300 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PspnO70300 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PspnO70300 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PspnO70300 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PspnO70300 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PspnO70300 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PspnO70300 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PspnO70300 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PspnO70300 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms