Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb5O55234 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms