Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrxO55103 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PrxO55103 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrxO55103 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrxO55103 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrxO55103 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrxO55103 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrxO55103 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrxO55103 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrxO55103 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrxO55103 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrxO55103 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrxO55103 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrxO55103 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrxO55103 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PrxO55103 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrxO55103 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrxO55103 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrxO55103 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrxO55103 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrxO55103 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrxO55103 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrxO55103 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrxO55103 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrxO55103 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrxO55103 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrxO55103 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PrxO55103 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrxO55103 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrxO55103 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrxO55103 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrxO55103 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrxO55103 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrxO55103 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrxO55103 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrxO55103 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrxO55103 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrxO55103 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrxO55103 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrxO55103 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrxO55103 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrxO55103 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PrxO55103 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PrxO55103 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrxO55103 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrxO55103 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrxO55103 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrxO55103 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrxO55103 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrxO55103 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrxO55103 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrxO55103 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PrxO55103 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrxO55103 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrxO55103 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrxO55103 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrxO55103 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrxO55103 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrxO55103 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrxO55103 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PrxO55103 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PrxO55103 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrxO55103 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrxO55103 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrxO55103 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrxO55103 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrxO55103 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrxO55103 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrxO55103 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrxO55103 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrxO55103 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrxO55103 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrxO55103 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PrxO55103 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrxO55103 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PrxO55103 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrxO55103 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PrxO55103 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PrxO55103 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PrxO55103 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PrxO55103 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrxO55103 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrxO55103 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrxO55103 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrxO55103 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrxO55103 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrxO55103 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrxO55103 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrxO55103 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrxO55103 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrxO55103 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrxO55103 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrxO55103 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrxO55103 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PrxO55103 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrxO55103 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrxO55103 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrxO55103 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrxO55103 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrxO55103 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms