Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffbO54788 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffbO54788 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffbO54788 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DffbO54788 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffbO54788 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffbO54788 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffbO54788 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffbO54788 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffbO54788 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffbO54788 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffbO54788 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffbO54788 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffbO54788 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffbO54788 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffbO54788 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffbO54788 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffbO54788 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffbO54788 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DffbO54788 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DffbO54788 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffbO54788 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffbO54788 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffbO54788 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffbO54788 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffbO54788 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffbO54788 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffbO54788 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DffbO54788 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffbO54788 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DffbO54788 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffbO54788 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffbO54788 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DffbO54788 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DffbO54788 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DffbO54788 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DffbO54788 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DffbO54788 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DffbO54788 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffbO54788 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffbO54788 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffbO54788 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffbO54788 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffbO54788 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffbO54788 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffbO54788 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffbO54788 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffbO54788 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffbO54788 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DffbO54788 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffbO54788 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffbO54788 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffbO54788 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffbO54788 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DffbO54788 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffbO54788 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffbO54788 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffbO54788 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffbO54788 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffbO54788 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffbO54788 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffbO54788 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffbO54788 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffbO54788 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffbO54788 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DffbO54788 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffbO54788 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DffbO54788 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffbO54788 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffbO54788 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffbO54788 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffbO54788 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffbO54788 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffbO54788 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DffbO54788 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffbO54788 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffbO54788 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DffbO54788 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms