Protein–RNA interactions for Protein: O54709

Klrk1, NKG2-D type II integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrk1O54709 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Klrk1O54709 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klrk1O54709 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klrk1O54709 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms