Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc1O35379 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Abcc1O35379 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms