Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Slc18a3O35304 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Slc18a3O35304 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc18a3O35304 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc18a3O35304 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc18a3O35304 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc18a3O35304 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc18a3O35304 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc18a3O35304 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc18a3O35304 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc18a3O35304 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc18a3O35304 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc18a3O35304 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc18a3O35304 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc18a3O35304 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc18a3O35304 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc18a3O35304 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Slc18a3O35304 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms