Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RrhO35214 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RrhO35214 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RrhO35214 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RrhO35214 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RrhO35214 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RrhO35214 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RrhO35214 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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RrhO35214 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RrhO35214 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RrhO35214 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RrhO35214 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RrhO35214 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RrhO35214 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RrhO35214 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RrhO35214 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RrhO35214 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RrhO35214 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RrhO35214 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RrhO35214 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RrhO35214 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RrhO35214 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RrhO35214 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RrhO35214 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RrhO35214 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RrhO35214 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RrhO35214 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RrhO35214 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RrhO35214 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RrhO35214 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RrhO35214 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RrhO35214 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RrhO35214 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RrhO35214 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RrhO35214 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RrhO35214 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RrhO35214 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RrhO35214 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RrhO35214 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RrhO35214 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RrhO35214 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RrhO35214 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RrhO35214 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RrhO35214 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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RrhO35214 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RrhO35214 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RrhO35214 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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RrhO35214 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RrhO35214 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RrhO35214 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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RrhO35214 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RrhO35214 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RrhO35214 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RrhO35214 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RrhO35214 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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RrhO35214 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RrhO35214 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RrhO35214 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RrhO35214 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RrhO35214 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RrhO35214 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RrhO35214 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RrhO35214 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RrhO35214 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RrhO35214 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RrhO35214 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RrhO35214 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RrhO35214 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RrhO35214 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RrhO35214 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RrhO35214 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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RrhO35214 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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RrhO35214 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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