Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kif3cO35066 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kif3cO35066 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Kif3cO35066 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms