Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcof1O08784 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcof1O08784 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tcof1O08784 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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