Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E2

Gm8271, Predicted gene 8271, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8271L7N2E2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm8271L7N2E2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8271L7N2E2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms