Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwa3bJ9JI28 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa3bJ9JI28 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms