Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Gm20877J3QPZ4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Gm20877J3QPZ4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Gm20877J3QPZ4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Gm20877J3QPZ4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm20877J3QPZ4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm20877J3QPZ4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Gm20877J3QPZ4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm20877J3QPZ4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20877J3QPZ4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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