Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5849J3QPE5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5849J3QPE5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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