Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20830J3KML6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20830J3KML6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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