Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chrna9G3X8Z7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna9G3X8Z7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms