Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
BicraF8VPZ9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
BicraF8VPZ9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
BicraF8VPZ9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BicraF8VPZ9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms