Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ercc6F8VPZ5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ercc6F8VPZ5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ercc6F8VPZ5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms