Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Gm20538F6Z9R1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms