Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Crocc2F6XLV1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Crocc2F6XLV1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
Crocc2F6XLV1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Crocc2F6XLV1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Crocc2F6XLV1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Crocc2F6XLV1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Crocc2F6XLV1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Crocc2F6XLV1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Crocc2F6XLV1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
Crocc2F6XLV1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms