Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933403O08RikF6UK53 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4933403O08RikF6UK53 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms