Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf165E9QAU8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Rnf165E9QAU8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Rnf165E9QAU8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Rnf165E9QAU8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Rnf165E9QAU8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Rnf165E9QAU8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Rnf165E9QAU8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Rnf165E9QAU8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Rnf165E9QAU8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Rnf165E9QAU8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Rnf165E9QAU8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Rnf165E9QAU8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Rnf165E9QAU8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Rnf165E9QAU8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Rnf165E9QAU8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Rnf165E9QAU8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Rnf165E9QAU8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf165E9QAU8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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