Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc7bE9Q9Y3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc7bE9Q9Y3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms